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南京鼓樓醫院，又名南京大學醫學院附屬鼓樓醫院，是一所集醫療
、教學、科研為一體的綜合性大型三級甲等醫院。前身是1892年由美國會資助的加拿大籍傳教士威廉·愛德華·麥克林醫學博士（William E. Macklin，中文譯音"馬林"）創建的一所"醫院"，馬林任首任院長，民間又稱"馬林醫院"。
鼓樓醫院由建院時50張病床，百余名員工，發展到現在已擁有核定床位2500張，在崗職工3830名，其中：衛生專業技術人員3395人，正、副主任醫師400余人，正、副教授180余人，博士生導師49人、碩士生導師196人，42位專家享受國務院特殊津貼。2015年醫院門急診病人310萬人次，出院病人8.6萬余例，年手術4.1萬臺。
鼓樓醫院科室設置齊全，技術力量雄厚。外科學是國家重點學科共建單位，骨科、產科、消化科、內分泌科、普通外科、風濕免疫科、腫瘤科和護理專業是國家重點專科，肝膽外科、骨科是江蘇省醫學中心，產科學、風濕免疫病學、腫瘤內科學、心胸外科學、代謝病學、麻醉學為江蘇省"科技興衛工程"重點學科。脊柱畸形矯治、肝移植、異基因間充質干細胞移植、生殖醫學、親體腎移植、消化系統疾病的內鏡診斷和介入技術、三維適形調強放療等技術處于或國內水平。普外科、婦產科、骨科、呼吸內科、免疫科、麻醉科、泌尿外科、
肝膽外科、消化內科、內分泌科、血液科、心胸外科、心血管內科、腫瘤科、整形燒傷科、醫學檢驗科、神經內科、急診醫學科、重癥醫學科、神經外科、耳鼻咽喉科、藥學部、病理科、醫學影像科為江蘇省重點專科，血管外科、感染科、腎內科、老年醫學科、核醫學科、疼痛科、中醫科為南京市醫學重點專科。2006年醫院被國家人事部批準設立"博士后科研流動工作站"，目前醫院有一級醫學博士學位授予點2個，二級學科博士學位授予點16個，碩士學位授予點25個，醫院被衛生部批準為專科醫師、藥師和心血管介入診療技術（心律失常介入）培訓基地。江蘇省醫院感染管理、骨科、婦產科、泌尿外科、消化科5個醫療質量控制中心及江蘇省腦血管疾病、圍產期疾病、脊柱畸形、消化內鏡、骨關節疾病、大血管疾病、代謝性疾病和風濕免疫性疾病8個江蘇省省級專科（病）診療中心均落戶在鼓樓醫院。醫院是國家衛生部開展路徑、護理服務示范工程重點單位之一。
鼓樓醫院擁有一大批的醫療設備，是江蘇省*獲得達芬奇手術機器人和TOMO系統兩項甲類配置證的地方醫院，其他設備還包括：PET-CT、ECT、ELEKTA雙光子直線加速器和寶石能譜CT、1.5T和3.0T磁共振、超聲內鏡系統、重癥監護系統、PACS影像存儲系統、全自動發藥系統和符合標準的百級凈化手術室等。
2004年，南京市委市政府決定向南擴建鼓樓醫院，并將其作為南京市發展社會公共事業的重點項目和民生工程，這是一座集門診、急診、住院病房和醫技檢查功能為一體、建筑面積22.4萬平方米，充分體現"以人為本"理念，彰顯文化、環保、生態、節能等元素的超大型智能化、現代化醫療綜合大樓。工程于2007年7月全面動工，2009年7月4日大樓結構封頂，2012年12月15日正式投入使用，日門診量可容納1.5萬人次，病床達到3000張。該大樓獲世界建筑新聞獎和國內建筑行業工程質量zui高獎——魯班獎。
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